Aoki Ikkou é um policial com a habilidade de leitura labial que foi transferido para uma nova divisão da polícia federal, a Seção 9. Essa Seção é conhecida pelo trabalho de investigação MRI, que é Reprodução de Imagem Mnemônica. O cérebro da vítima morta é examinado através das lembranças que são reproduzidas por imagens.

Himitsu é um anime que retrata os segredos de vítimas de assassinato sendo assistidos por policiais, e a agonia dos investigadores em ter que assisti-los à força.